Entiendo. Lo de separar las baterías es por el BMS (bueno, 'los BMS', porque cada batería Pylontech lleva su propio BMS), no por la batería en sí. Me parece muy razonable.
Entonces, si @carlos66 ahora tiene 6 Pylontech en paralelo, que los separe y conecte un pack de 3 Pylontech en paralelo a cada inversor.
Respecto eso de 'hablar con el fabricante' (Goodwe) podría ser difícil o incluso imposible.
Yo diría que @carlos66 puede paralelizar la salida AC de sus dos inversores y controlar como reaccionan los 'meter' (no sé lo que es un 'meter').
Si el 'meter' es un watímetro incorporado en el inversor, cada uno medirá lo que entrega su inversor.
Si el 'meter' es un dispositivo independiente, marcará la suma de los kW o kWh entregados por los inversores, conectándolo aguas abajo de la conexión en paralelo de los dos inversores.